Coro alto, con un órgano de ecos a distancia
Órgano de Organería Española
El órgano actual lo construyó Organería Española, de Azpeitia, entre 1953 y 1954, y se inauguró el 19 de enero de 1954. Lo pagó el legado del donostiarra Fermín Lasala, duque de Mandas. En la inauguración se estrenaron obras de compositores vascos, y el Tríptico del Buen Pastor de Jesús Guridi ganó el primer premio del concurso convocado para la ocasión.
Sustituyó al órgano original del templo, de Aquilino Amezua, en el que ejercieron los dos primeros organistas de la parroquia, José Luis Zapirain (1863-1949) y Juan María Ugarte (1878-1956). Tiene cinco teclados manuales y pedal, con un órgano de ecos que se toca desde la consola principal, y es de los mayores de España y de Europa.
- Organero: Organería Española S. A. (Azpeitia), 1953-1954
- Inaugurado el 19 de enero de 1954, con el legado de Fermín Lasala, duque de Mandas
- Cinco teclados manuales de 61 notas y pedal de 30
- 124 registros, según la disposición publicada, incluidos los del órgano de ecos
- Transmisión eléctrica; consola con combinaciones electrónicas
- Sustituyó al primer órgano del templo, de Aquilino Amezua
Restauraciones
- 1954 · Organería Española
- Construcción e inauguración, el 19-1-1954
- 2007 · Bernal-Korta
- Restauración y nueva consola de combinaciones electrónicas

